西北农林科技大学水利与建筑工程学院的前身为水利专修班，由中国近代国内外著名在师李仪祉先生1932年在西安创立，1934年西北农林专科学校成立，水利班遂归并于该校，成立水利专业教学组。1937年著名水利专家沙玉清先生受李仪祉先生、辛树帜校长的邀请，就任于水利专业组教授兼主任。1939年4月西北农学院正式成立，水利组改称为农业水利系。
        在1956年全国高等院校大调整中，西北工学院的水利系、电机系与青岛工学院的水利系（以1901年创建的山东大学所属土木系的水利组为前身）合并，组成了西安动力学院水力系，包括水利、热力和电力三个专业。1957年，西安动力学院又全院和西北农学院水利系并入西安交通大学，两个学院的水力系合并为西安交通大学水利系。原西北工学院和西北农学院的水利系（1950年又有兰州大学水利系并入）实行了由西北联合大学分出后的第一次的合并。1960年，由于当时经济建设的需要，在原西安动力学院校址成立了陕西工业大学。
        1981年，陕西省根据当时实际的办学条件又将西北农学院的水利系 “一分为二”。在陕西机械学院成立了水利系，实行机械工业部与水利电力部的联合办学。原西北农学院的水利专业部分继续为西北农学院水利系。
        西北农学院水利系在1999年改为西北农林科技大学水利与建筑工程学院，现有5个本科专业。