南京水利科学研究院岩土工程研究所的发展历史可追溯到1935年，是由我国岩土工程学科奠基人、中国科学院院士黄文熙在我院前身——中央水工试验所基础上创建的专业科研机构。
        20世纪40年代开始进行土工试验方法的研究，本所开发了我国第一、第二代土工试验仪器，编制了水利部《土工试验规程》SL237-1999及国家标准《土工试验方法标准》GB/T50123-1999，50年代举办了4期全国土工试验培训班，为我国土工测试技术的发展培养了一大批人才。
        自20世纪50年代开始，对于我国东南地区的软土的物理力学特性，变形与强度特性，以及软土的测试技术等进行深入研究，为沿海地区的水利、公路、港口工程建设提供了技术依据。出版了《软粘土的强度和变形》等学术专著。
        20世纪60年代初开展了软土地基加固技术开发工作，在国内率先研究与推广了真空预压法、振动水冲法、动力固结法等软基加固方法，出版了《软土加固新技术—振动水冲法》、《真空排水预压的理论与实践》等专著。